Vliv aberantní separace fází na regulaci genové exprese v onkologii
Náš tým tvoří mladí, vysoce motivovaní odborníci z různých oborů, kteří
jsou vybaveni potřebnými odbornými znalostmi a portfoliem přístrojů k dosažení
našich cílů. Náš tým si klade za cíl být průkopníkem ve zkoumání role fázové
separace v experimentální onkologii. Fázová separace, která vytváří
biokondenzáty, se ukázala jako klíčový jev při progresi rakoviny. Abnormální fázová
separace má za následek chybnou lokalizaci proteinů, mění buněčnou
subkompartmentalizaci a přispívá k rozvoji různých druhům rakoviny. Identifikovali
jsme jaderné faktory, které regulují schopnost fázové separace interagujících
proteinů tím, že zvyšují jejich lokální koncentraci, a ovlivňují tak tvorbu kondenzátů,
které jsou klíčové pro regulaci genové exprese. Cílem našeho výzkumu je
objasnit úlohu fázové separace proteinů při modulaci transkripčních regulátorů
specifických pro jednotlivé typy rakoviny. Spolupracujeme s předními
institucemi v ČR I zahraničí (BIOCEV, IMG, Universitätsklinikum Köln). Multidisciplinární
přístup nám umožňuje hlouběji porozumět buněčné kompartmentalizaci v podmínkách
zdraví a rakoviny. V průběhu našeho výzkumu budeme hodnotit schopnost fázové
separace mutovaných proteinů in vivo a in vitro. Zkoumání míry proliferace,
transformační potenciál a invazivitu modelových buněčných systémů za účelem
identifikace potenciálních terapeutických cílů zlepší naše chápání agresivního
chování nádorů a jejich metastatické schopnosti, což jsou zásadní problémy v
léčbě rakoviny. Náš přístup integruje mikroskopické metody s pokročilou
proteomiku, bioinformatiku, klasickou biochemií, proteinovým inženýrstvím a
systémy in vitro rekonstituce. Cílem je vyvinout indukovatelné systémy pro
sledování dynamických procesů v živých buňkách.
